醫療質量建設是醫院管理體系的核心。為加強醫療質量管理，增加行業自律，不斷提高醫療質量和醫療服務水平，經省衛健委批準，福建省麻醉專業醫療質量控制中心、福建省藥事管理專業醫療質量控制中心、福建省核醫學專業醫療質量控制中心、福建省整形美容專業醫療質量控制中心、福建省高血壓病醫療質量控制中心、福建省神經系統疾病質量控制中心、福建省骨科專業醫療質量控制中心、福建省眼科專業醫療質量控制中心、福建省罕見病醫療質量控制中心、福建省疼痛專業醫療質量控制中心、福建省皮膚和性傳播疾病醫療質量控制中心，共計11個省級醫療質量中心靠掛于我院。
在省衛健委和醫院的指導和支持下，各質控中心充分發揮省級質控中心作用，逐步在各專業領域建立和完善我省醫療質量管理與控制體系，指導各級醫療機構醫療行為規范，保障醫療質量和醫療安全。主要承擔：組織制訂和實施專業質量規范、工作流程、質量控制標準和方法；組織開展專業培訓；制訂全省相關專業質量控制方案，開展質控評價；及時向省衛健委報告專業質量控制工作情況等工作，對全省相關領域醫療質量控制起了引領示范作用，推動全省相關專業醫療質量穩步發展。
