中共福建省委、福建省人民政府于2021年5月18日印發《關于進一步深化醫藥衛生體制改革的意見》，其中提出，“按照‘大專科、小綜合’思路，實施新一輪醫療‘創雙高’，推進心血管病等10個省級臨床醫學中心、燒傷科等20個國家臨床重點專科建設，保持領先不掉隊；加強心血管內科等26個專科建設，爭取培育成為新一批國家臨床重點專科”。
根據省委、省政府工作部署，醫院以高質量發展為統攬，落實公立醫院高質量發展實施方案，重視研究型醫院建設工作，充分把握建設國家區域醫療中心和福建省新一輪醫療“創雙高”機遇，在強自身的基礎上，借助華山醫院學科優勢，推進優勢學科建設，優化學科整體發展戰略布局，做精做細特色，加強內外協作，凝練學科方向，提高學科綜合實力和影響力。
目前，醫院共有3個高水平醫學中心，10個國家臨床重點專科及26個省級臨床重點專科。根據國家及省級臨床重點專科建設的目標和要求，全力以赴在建設周期內提升學科建設成效，進一步加強臨床專科能力建設及項目管理，同時，不斷完善診療流程和提高服務質量，努力創建高水平中心，不斷提升醫院綜合實力和競爭力，推動醫院高質量發展。
