胃腸外科二區是國家臨床重點專科及福建省臨床重點專科，也是福建省創傷醫學中心重要臨床基地，長期以胃腸道疾病的診斷和微創治療理念為發展方向。科室團隊技術高超，實力雄厚，處于省內領先水平，作為福建醫科大學碩、博士學位培養點和博士后培養點，國家住院醫師規范化培訓以及專科醫師臨床與科研培訓基地，是集臨床、科研、教學于一體的胃腸道專科和胃腸道腫瘤中心。科室為福建省醫學會外科學分會外科手術學組、福建省中西醫結合學會普通外科分會、福建省抗癌協會腹膜腫瘤專委會、福建省中西醫結合學會普通外科分會胃腸外科學組等社會團體組長單位或主委單位。
胃腸外科二區目前開放床位80張（茶亭院區60張，濱海院區20張），配備醫師20名，其中高級職稱醫師12名，中級4名，初級4名。科室人才儲備充足，均擁有博士或碩士學位，多位醫師先后赴日本和美國進修學習。科室擁有博士生導師3人，碩士生導師6人，培養碩、博士研究生百余人，為社會輸送了大量的專業人才。
科室每年完成1500多臺手術，開展的診療項目包括：胃癌、結直腸癌、腸瘺、炎癥性腸病、胃腸間質瘤、胃腸息肉、直腸肛門良性疾病（痔瘡、肛腸專業）、胃腸外科良性疾病的診治（如減重代謝手術、便秘手術、抗反流手術等）等胃腸道疾病。同時，科室長期致力于胃腸外科微創手術的研究探索，開展了包括腹腔鏡和達芬奇機器人輔助下胃癌根治術、腹腔鏡和達芬奇機器人輔助下結直腸癌根治術、腹腔鏡和達芬奇機器人輔助下超低位直腸癌保肛手術、腔鏡經肛門直腸癌全系膜切除術（Ta-TME）等學科前沿技術，大力推行規范的胃癌根治術、結直腸癌根治術治療，深入貫徹加速康復理念（ERAS），積極傳播胃癌和結直腸癌現代外科治療新理念，在腹腔鏡下胃癌、結直腸癌的新療法領域有著突出的成績。同時，科室本著以“患者為中心”的理念，特色化開展多學科討論（MDT）制度，對腫瘤病例及疑難病例進行充分評估，詳細分析，綜合各學科意見，制定合理的治療方案，對患者生存時間的延長、生存質量的改善至關重要。
在科研工作方面，近年來科室獲得3項國家自然科學基金和30余項省級廳級課題項目，在消化道惡性腫瘤領域的基礎科研中取得了一系列的研究成果。全科發表國內核心期刊論文百余篇，SCI論文40余篇，研究成果先后獲得福建省級、廳級醫藥衛生科技進步二等獎2項、三等獎4項，取得良好的社會效益。
數據截至2023年6月30日
