隨著科技興院戰略的深人實施，醫院的科研任務、科研經費比重也相應加大，國家對科研經費管理的要求也越來越嚴格，每個專項經費都有對應的專項經費管理辦法，國家科技部2006年頒布了《關于嚴肅財經紀律規范國家科技計劃課題經費使用和加強監管的通知》；我省2007年也出臺了《福建省科技計劃項目經費管理辦法》。依據以上管理要求，建立網絡化的科研經費管理模式已勢在必行。在院領導的重視下，科研科根據積累多年科研經費管理經驗和存在的問題，經過充分醞釀、討論，制訂出符合管理要求的網絡管理程序，在信息科、財務科等科室的大力支持和配合下，科研經費信息管理系統2008年年底開始試運行，今年2月份正式投入使用，實現了科研經費信息化管理。
該網絡化科研經費管理系統的建立，使科研部門實現了與財務、藥房、行政和設備倉庫之間管理信息數據共享，形成經費使用的監控網絡，嚴格控制了經費開支范圍，使科研經費按合同預算有效執行。既有利于課題組計劃使用經費，避免超支現象，同時又使財務核算、監督審計更為快速、準確。此管理模式使我院科研經費管理邁上了一個新臺階，從而更加適應當前科技與經濟發展的需求。
